L'idée est de faire une première ~demi journée de présentation/formation introductive puis un grand temps d'échange (~2 jours) de travail en petits groupes
Matin 19 : Intro ( 11h- 12H)
- Introduction aux journées en présentant la vision FAIR du PNDB
Après-midi 19 : plusieurs intervenants (13h-18h) :
- Aspect outils "génériques" de développement en écologie, orienté R
- Formation rapide introductive à GIT et github
- Bonnes pratiques de travail avec R / science reproductible / workflow / package via R, RStudio et Shiny
- Formation rapide introductive à Docker avec application en SIG
- Aspect Métadonnées
- Formation rapide introductive à l'EML
- Aspect Analyse de données
- Formation rapide introductive à dev Galaxy dont conda
Matin 20 (9h) -> Après-midi 21 (16h) : Travail en petits groupes / Hackathon / Collaboration Fest
- Sujets potentiels - développements "métadonnées" liés aux standards utilisés en écologie (Darwin-core / EML / ISO19115 / ISO19110...) et/ou aux catalogues de données/métadonnées (GeoNetwork/Metacat/Dataverse/Zenodo...)
- développement de scripts R en mode function / package
- développement d'applications R Shiny
- containerisation d'applications R Shiny pour intégration dans Galaxy
- développement d'outils Galaxy à partir de scripts R
- développement de matériels de formation 'e-learning" via l'infrastructure du Galaxy Training Network